梵蒂冈是以教宗为君主的政教合一的主权国家。中央机构设有国务院、圣部、理事会等。

国务院是教宗直接领导的工作机构，协助教宗行使职权，主管内政和外交事务，由枢机主教衔的国务卿领导。国务卿由教宗任命，管理梵蒂冈行政并掌管教宗枢密事务。圣部负责处理天主教的各种日常事务，各部由部长负责，下设秘书长和副秘书长。现有信理部、万民福音部、东方教会部、礼仪与圣事部、圣职部、修会部、主教部、册封圣人部、天主教教育部等9个圣部。

理事会负责处理一些专门事务，包括平信徒理事会、正义和平理事会、家庭理事会、跨宗教对话理事会、新福音推广理事会等12个理事会。各理事会由主席负责，一般由枢机主教担任，任期5年，下设秘书长和副秘书长。

梵蒂冈国旗由两个面积相等的竖长方形组成，靠旗杆侧为黄色，另一侧则为白色，绘有教宗的牧徽。国徽是背衬着红色的教宗保禄六世的宗徽。国歌为《教宗进行曲》。